شناسایی جایگاه‌های چند شکلی مهم بر روی ژن MSH2 در نمونه‌های سرطان کلورکتال با استفاده از آنالیز نقطه ذوب با وضوح بالا

Authors

آیریان, سعید گروه زیست سلولی و مولکولی ، دانشگاه خوارزمی، تهران، ایران

انگجی, سید عبدالحمید گروه زیست سلولی و مولکولی ، دانشگاه خوارزمی، تهران، ایران

بهاری, عباس گروه بیوتکنولوژی، پژوهشکده فناوری‌های نوین زیستی، دانشگاه زنجان، زنجان، ایران

نعمتی, محسن گروه زیست سلولی و مولکولی ، دانشگاه خوارزمی، تهران، ایران

Abstract:

چکیده زمینه و هدف: سرطان کلورکتال(CRC) دومین سرطان شایع در کشورهای توسعه یافته است. بیشتر از 10 درصد CRC به صورت ارثی می‌باشد و شامل سندرم لینچ HNPCC وFAP می‌باشد. ژن MSH2 بر روی کروموزم 2(p21) قرار دارد و از 16 اگزون تشکیل شده است. MSH2 پروتئینی است که در فرایند ترمیمی‌MMR بعد از همانندسازیDNA نقش دارد. پروتئین MSH2 به MSH6 یا MSH3 متصل شده و کمپلکس‌های MutSα و MutSβ را تشکیل می‌دهد که به ترتیب ناجورجفت‌های deletion/insertion کوچک و بزرگ را شناسایی می‌‌کنند. هدف اصلی این تحقیق بررسی کارایی و توانایی HRMA در تشخیص جهشهای حذفی سه نوکلئوتیدی و تعیین فراوانی این جهش‌ها در حالت هموزیگوس وهتروزیگوس در نمونه‌های سرطان روده بزرگ نسبت به گروه کنترل می‌باشد. روش بررسی: در پژوهش موردـ شاهدی که در سال 1396ـ 1395 انجام شد، به منظور ردیابی جهش حذفی سه نوکلئوتیدیGTG در موقعیت اگزون 12 ژن MSH2 از تکنیک HRMA استفاده شد. بدین منظور50 نمونه سرطان کلورکتال به همراه 50 نمونه سالم مورد بررسی قرار گرفت. ابتدا DNA ژنومی ‌از نمونه‌های بافت پارافینه سرطانی استخراج شد و سپس با تکنیک HRMA و تعیین توالی یابی مستقیم جهش حذفی سه نوکلئوتیدی GTG مورد بررسی قرار گرفت. کنترل‌های به کار گرفته شده شامل توالی 96 جفت بازی در حالت تیپ وحشی و 93 جفت‌بازی در حالت موتانت بود. نسبت مساوی از این دو برای حالت هتروزیگوس این جایگاه به کار گرفته شد. در نهایت تعداد نمونه‌های به دست آمده در هر گروه در آزمون تجزیه واریانس یک‌طرفه و مقایسه میانگین LSD مورد مقایسه آماری قرار گرفتند. یافته‌ها: تعداد نمونههای هتروزیگوس برای این جایگاه در نمونههای سرطان روده بزرگ به طور معنی‌داری نسبت به دو گروه هموزیگوس حاوی توالی و هموزیگوس حذف کامل بیشتر بود. در مجموع نتایج این پژوهش نشان داد که تکنیک HRMA قابلیت تفکیک حذف و الحاق جفت بازها به صورت هموزیگوس و هتروزیگوت را با توجه به اختلاف دمای ذوب(Tm) آنها را دارد نتیجه‌گیری: در مطالعه حاضر با توجه به نتایج به دست آمده فراوانی حذف سه نوکلئوتیدی GTG در نمونه‌های سرطانی نسبت به افراد سالم به صورت معنی‌داری بیشتر بود. سرطان کلورکتال، HNPCC، تکنیکHRMA، ژن MSH2

Upgrade to premium to download articles

Already have an account?login

similar resources

اثر بربرین در تنظیم آستروسیتهای Gfap+ ناحیه هیپوکمپ موشهای صحرایی دیابتی شده با استرپتوزوتوسین

Background: Diabetes mellitus increases the risk of central nervous system (CNS) disorders such as stroke, seizures, dementia, and cognitive impairment. Berberine, a natural isoquinolne alkaloid, is reported to exhibit beneficial effect in various neurodegenerative and neuropsychiatric disorders. Moreover astrocytes are proving critical for normal CNS function, and alterations in their activity...

full text

اثر بربرین در تنظیم آستروسیتهای Gfap+ ناحیه هیپوکمپ موشهای صحرایی دیابتی شده با استرپتوزوتوسین

full text

آنالیز منحنی ذوب با شفافیت بالا به منظور شناسایی سریع و دقیق باکتری سالمونلا با استفاده از ژن invA

سابقه و هدف: سالمونلوز یکی از بیماریهای عفونی و مشترک بین انسان و حیوانات است. که به وسیله سویه های مختلف باکتری سالمونلا ایجادمی گردد. پیشرفت در روشهای تشخیص مولکولی، شناسایی پاتوژنهای غذایی را دقیقتر و راحت کرده است. به هرحال تشخیص سریع و تمایز سروتیپ های سالمونلا می تواند بعنوان یک مشکل در آزمایشگاه های تشخیص قابل توجه باشد.شناسایی و تفکیک عامل بیماری به وسیله روشهای بیوشیمیایی و فنوتیپی کار...

full text

مقایسه تأثیر وضعیت طاق باز و دمر بر وضعیت تنفسی نوزادان نارس مبتلا به سندرم دیسترس تنفسی حاد تحت درمان با پروتکل Insure

کچ ی هد پ ی ش مز ی هن ه و فد : ساسا د مردنس رد نامرد ي سفنت سرتس ي ظنت نادازون داح ي سکا لدابت م ي و نژ د ي سکا ي د هدوب نبرک تسا طسوت هک کبس اـه ي ناـمرد ي فلتخم ي هلمجزا لکتورپ INSURE ماجنا م ي دوش ا اذل . ي هعلاطم ن فدهاب اقم ي هس عضو ي ت اه ي ندب ي عضو رب رمد و زاب قاط ي سفنت ت ي هـب لاتـبم سراـن نادازون ردنس د م ي سفنت سرتس ي لکتورپ اب نامرد تحت داح INSURE ماجنا درگ ...

full text

ارزیابی چند شکلی ژن آروماتاز در گوسفند زندی با استفاده از روش PCR-RFLP

full text

افزایش خطر ابتلا به سرطان معده با چند شکلی VNTR ژن SIRT3

Background and purpose: Gastric cancer is the most common cancer associated with high mortality worldwide. One of the genes that is down-regulated in gastric cancer, is the SIRT3 that encodes the histone deacetylase enzyme. There is a variable number tandem repeat (VNTR) polymorphism in the intron 5 of SIRT3 gene and evidence shows that expression of SIRT3 gene increases by increase in the numb...

full text

My Resources

Save resource for easier access later

Save to my library Already added to my library

{@ msg_add @}

Journal title

ارمغان دانش

volume 23 issue 4

pages 516- 527

publication date 2018-10

unfollow

{@ msg @}

By following a journal you will be notified via email when a new issue of this journal is published.

Keywords

No Keywords

Hosted on Doprax cloud platform doprax.com